2006년식(2005년부터 생산된 모델) 가야르도가 엄청나게 많이 변했으며, 이로 인해 람보르기니 오너들과 언론으로부터 엄청난 비난을 받았다. 비난을 받은 모델이 바로 한정판 모델인 가야르도 SE로부터 파생된 모델이다. 소음공해를 막는 방음장치를 뒤집어서 설치해 외향적으로 더 스포티하게 변했고, 새로운 배기구 시스템과 개선된 서스펜션, 랙이 구비된 운전대, 20마력이 상승한 엔진 등은 논외였지만 전체적으로 엉망이 돼버린 1~5단 변속장치 등이 유달리 많은 비난을 받았다.